RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PNKDQ8N490 385 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF488Q96MN9 340 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 H3BUT2 72 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 PDE6DO43924 150 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 B4GALT1P15291 398 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 BCL3P20749 454 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2G1P62253 170 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF611Q8N823 705 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 JMJD8Q96S16 334 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 CCL3P10147 92 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 G6PCP35575 357 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 FABP6P51161 128 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00205P59089 165 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 OR4S2Q8NH73 311 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 H0YJW9 148 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 OR2D2Q9H210 308 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-211ENST00000618610 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 DEGS1O15121 323 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CD1BP29016 333 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SRD5A2P31213 254 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 V9GYV3 84 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf142B7Z368 130 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FOXH1O75593 365 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MT-CO2P00403 227 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 APCSP02743 223 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CAMPP49913 170 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF585BQ52M93 769 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MIC13Q5XKP0 118 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 WDR73Q6P4I2 378 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PERPQ96FX8 193 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 A0A096LPE4 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPZ6 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RAMP3O60896 148 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF32P17041 273 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RAB9AP51151 201 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SSX8Q7RTT4 187 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FGFRL1Q8N441 504 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FAM168AQ92567 244 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YW62 118 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZIC3O60481 467 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ACTL6BO94805 426 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-1P01715 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CELA3AP09093 270 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PLP1P60201 277 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SCGB2A2Q13296 93 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 VWC2Q2TAL6 325 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PCSK4Q6UW60 755 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SPSB1Q96BD6 273 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 AP1S3Q96PC3 154 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf70A6NJV1 201 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 AHRRA9YTQ3 701 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TFF1P04155 84 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TM4SF20Q53R12 229 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK14Q6IE38 97 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 AAED1Q7RTV5 226 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN23Q96B33 292 aa6.82□□□□□ -1.32
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