RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610369.4

TARDBP-211, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-211ENST00000610369 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 OR11H12B2RN74 326 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 KRASP01116 189 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 IGHV3-23P01764 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 RLN1P04808 185 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 REG1AP05451 166 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 SERPINE2P07093 398 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 OR13C7P0DN81 318 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 MYOD1P15172 320 aa7.3□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 PLET1Q6UQ28 207 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 OR5B3Q8NH48 314 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.3□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.3□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 TMEM213A2RRL7 107 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 CD7P09564 240 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 C8orf88P0DMB2 117 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 HLA-DMAP28067 261 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 RCVRNP35243 200 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 UCP3P55916 312 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 MZT2AQ6P582 158 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 IL17DQ8TAD2 202 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.29□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.29□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 S4R3C0 116 aa7.29□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.28□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.28□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 AP3S1Q92572 193 aa7.28□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 HINT2Q9BX68 163 aa7.28□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.28□□□□□ -1.24
TARDBP-211ENST00000610369 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.28□□□□□ -1.24
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TARDBP-211ENST00000610369 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 ELK1P19419 428 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 TBPP20226 339 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.27□□□□□ -1.25
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TARDBP-211ENST00000610369 OR4A16Q8NH70 328 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 MLXQ9UH92 298 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 OR2T8A6NH00 312 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 C15orf61A6NNL5 157 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 FAM25AB3EWG3 89 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 FAM25CB3EWG5 89 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 FAM25GB3EWG6 89 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 K7EMT4 169 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 NDUFA4O00483 81 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-211ENST00000610369 HPGDSO60760 199 aa7.26□□□□□ -1.25
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