RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CLCC1Q96S66 551 aa6.15□□□□□ -1.42
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ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R1AQ13522 171 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM187Q14656 261 aa6.12□□□□□ -1.43
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ZNF548-208ENST00000597576 ZNF585BQ52M93 769 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-208ENST00000597576 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-208ENST00000597576 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF429Q86V71 674 aa6.12□□□□□ -1.43
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ZNF548-208ENST00000597576 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.12□□□□□ -1.43
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