RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GGHQ92820 318 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GALNT14Q96FL9 552 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DERL3Q96Q80 235 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RARRES2Q99969 163 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TM2D1Q9BX74 207 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 Q9N2K0 584 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NAGKQ9UJ70 344 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 S4R3C0 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 IRGMA1A4Y4 181 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RLN1P04808 185 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf88P0DMB2 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PSMB6P28072 239 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINB10P48595 397 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MED21Q13503 144 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MMD2Q8IY49 270 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GPX8Q8TED1 209 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 APH1BQ8WW43 257 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 APLNQ9ULZ1 77 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0A6YYD4 124 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MPTX1A8MV57 137 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TRDCB7Z8K6 153 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SOCS1O15524 211 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ST8SIA3O43173 380 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R43P59537 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2G2P60604 165 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 UNC119Q13432 240 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RAB32Q13637 225 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CDK10Q15131 360 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TTC23Q5W5X9 447 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CBR4Q8N4T8 237 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR5B3Q8NH48 314 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PHYHIPQ92561 330 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 CSTL1Q9H114 145 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 KCNK15Q9H427 330 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PKD1P98161 4303 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE10A6NGK3 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR4C46A6NHA9 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TEX22C9J3V5 150 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FCER2P06734 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MYOD1P15172 320 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ALDH3B2P48448 385 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MFAP2P55001 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 AP3S2P59780 193 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H2Q8NH07 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM80Q96HE8 168 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.69□□□□□ -1.34
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