RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 KCNJ3P48549 501 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 GZMMP51124 257 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 RAB9AP51151 201 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB136Q30KP8 78 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SSX9Q7RTT3 188 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 CEND1Q8N111 149 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 MREGQ8N565 214 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ASB9Q96DX5 294 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD7Q96MP8 289 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 RARRES2Q99969 163 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TVP23AA6NH52 213 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 FFAR1O14842 300 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 IFNA4P05014 189 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OCM2P0CE71 109 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 STAG3L3P0CL85 134 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 PRKACBP22694 351 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT2P50583 147 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL12Q53G59 568 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OTPQ5XKR4 325 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM42Q69YG0 159 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 C22orf42Q6IC83 251 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 CNIH2Q6PI25 160 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 OTOSQ8NHW6 89 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 THEM6Q8WUY1 208 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ARPC1AQ92747 370 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SLC29A1Q99808 456 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 IL20Q9NYY1 176 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SORL1Q92673 2214 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ODAMA1E959 279 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 HMGN1P05114 100 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SPI1P17947 270 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 NFYBP25208 207 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 PYCR1P32322 319 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 BMI1P35226 326 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 RBP2P50120 134 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TNFRSF9Q07011 255 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 PP6455Q8WZ26 134 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 BORCS8Q96FH0 119 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 HERC2O95714 4834 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 H3BUA1 57 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 SIRPB1O00241 398 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 MRASO14807 208 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DRB1P01911 266 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 FXYD6P3P58550 94 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 PAX5Q02548 391 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00311Q8N616 119 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N9W7 124 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-208ENST00000578600 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms