RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MARC2Q969Z3 335 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UFC1Q9Y3C8 167 aa21.14■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RLN1P04808 185 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FGF2P09038 288 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MARCH11A6NNE9 402 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC2P0DI81 140 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC2BP0DI82 140 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR13C7P0DN81 318 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RFX2P48378 723 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE2NLQ5JXB2 153 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GGTLC1Q9BX51 225 aa21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAV25A0A0B4J276 109 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PMP2P02689 132 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C8orf88P0DMB2 117 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM69Q5SWH9 247 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC25A24Q6NUK1 477 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DHRS11Q6UWP2 260 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR1L8Q8NGR8 309 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VN1R17PQ8TDU5 208 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MOB3AQ96BX8 217 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HINT2Q9BX68 163 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BIRC6Q9NR09 4857 aa21.11■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TGOLN2O43493 480 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SERPINE2P07093 398 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 F2RP25116 425 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ELLP55199 621 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAS2R20P59543 309 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WT1-ASQ06250 92 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SAMD12Q8N8I0 201 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR1L6Q8NGR2 347 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR5H2Q8NGV7 314 aa21.1■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2T8A6NH00 312 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANAPC10Q9UM13 185 aa21.09■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRASP01116 189 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS19P39019 145 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LPAR6P43657 344 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAS2R46P59540 309 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CMTM1Q8IZ96 169 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FCAMRQ8WWV6 532 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM190Q8WZ59 177 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NSG2Q9Y328 171 aa21.08■□□□□ 0.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LSM3P62310 102 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FXYD6Q9H0Q3 95 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR51B2Q9Y5P1 312 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALMS1Q8TCU4 4167 aa21.07■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNAPC5O75971 98 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 G6PCP35575 357 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC38A6Q8IZM9 456 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2C3Q8N628 320 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OVOL2Q9BRP0 275 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C5orf66Q9H5L9 145 aa21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NAT1P18440 290 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRSS3P35030 304 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR6F1Q8NGZ6 308 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C21orf62Q9NYP8 219 aa21.05■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPR31O00270 319 aa21.04■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MFAP2P55001 183 aa21.04■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPSB3Q6PJ21 355 aa21.04■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBAC2Q8NBM4 344 aa21.04■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-DMAP28067 261 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HRH1P35367 487 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCARB1Q8WTV0 552 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 YIPF6Q96EC8 236 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C20orf24Q9BUV8 137 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBQLN2Q9UHD9 624 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRNDQ9UKY0 176 aa21.03■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NDUFA4O00483 81 aa21.02■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHLDA2Q53GA4 152 aa21.02■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM56Q96MV1 263 aa21.02■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHRDL1Q9BU40 450 aa21.02■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.02■□□□□ 0.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSPAN4O14817 238 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q56UQ5 140 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CADM3Q8N126 398 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FKBP11Q9NYL4 201 aa21.01■□□□□ 0.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 K7EIM0 57 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms