RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 OR52E5Q8NH55 327 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 SDK2Q58EX2 2172 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 GOSR1O95249 250 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TIMP3P35625 211 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 REG1BP48304 166 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 NIT1Q86X76 327 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 OCC1Q8TAD7 63 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPB3Q92617 1050 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PLAUP00749 431 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 STAG3L3P0CL85 134 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TCF24Q7RTU0 167 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TCF23Q7RTU1 214 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 EPOPA6NHQ4 379 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 C9JCJ5 164 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 GZMBP10144 247 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PATE3B3GLJ2 98 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 YPEL1O60688 119 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 YPEL2Q96QA6 119 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CEP290O15078 2479 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 NUDT3O95989 172 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CD3EP07766 207 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CD55P08174 381 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 UQCRFS1P47985 274 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 Q6AWC8 147 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PNKDQ8N490 385 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TM4SF5O14894 197 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MMDQ15546 238 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A1L4Q6 167 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 C16orf97H3BN30 126 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 WNT9BO14905 357 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RNF144BQ7Z419 303 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A8MWP6 167 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TWIST1Q15672 202 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ARF6P62330 175 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PSG7Q13046 419 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 OR9G1Q8NH87 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GPR82Q96P67 336 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 C15orf61A6NNL5 157 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A17O43808 307 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 IL15RAQ13261 267 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 HCP5Q6MZN7 132 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SHISA5Q8N114 240 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 FMC1Q96HJ9 113 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1-5P01602 117 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PSG9Q00887 426 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 EFNB3Q15768 340 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SVILO95425 2214 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GUT8 65 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 M0QZ24 198 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GCSHP23434 173 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CCL8P80075 99 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 HES7Q9BYE0 225 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.69□□□□□ -1.02
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