RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 APCP25054 2843 aa22.9■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CRYGBP07316 175 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFS8O00217 210 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 CA2P00918 260 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 H2AFB1P0C5Y9 115 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF7P21781 194 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPSB3Q6PJ21 355 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1B0GW64 132 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 FNDC10F2Z333 226 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPDU1O75352 247 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf83Q53S99 150 aa22.88■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HINT2Q9BX68 163 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A17O43808 307 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFNA4P05014 189 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPCDR1Q9BY65 106 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLQO75417 2590 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PN81 502 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX15O60248 233 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXH1O75593 365 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNA7P36544 502 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 LCN2P80188 198 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM41BQ5BJD5 291 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 C10orf91Q5T1B1 145 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGPAT2O15120 278 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1C1Q04828 323 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MBD3L1Q8WWY6 194 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 OOSP1A8MZH6 123 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 VWC2LB2RUY7 222 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 HBE1P02100 147 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN1MWP04001 364 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN1MW2P0DN77 364 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN1MW3P0DN78 364 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAX1P15863 534 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLRD1Q13241 179 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MINOS1Q5TGZ0 78 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MMD2Q8IY49 270 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM168AQ92567 244 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TREM1Q9NP99 234 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 CGB1A6NKQ9 187 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 C17orf112F2Z3M2 114 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-210ENST00000574322 MBP02144 154 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF709Q8N972 641 aa22.83■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-210ENST00000574322 E7EUB6 86 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PBDC1Q9BVG4 233 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMDT1Q9H4I9 107 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPVFQ9HCQ7 196 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TPSG1Q9NRR2 321 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA1456Q9P272 454 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VENTXO95231 258 aa22.82■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10W1Q8NGF6 305 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 SFT2D1Q8WV19 159 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITPR2Q14571 2701 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF726P1Q15940 193 aa22.81■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADCYAP1P18509 176 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5J2P56134 94 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCL20P78556 96 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB113Q30KQ7 82 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 PERPQ96FX8 193 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOX4O94842 621 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTFRP26992 372 aa22.79■■□□□ 1.24
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