RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 ZNF114Q8NC26 417 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 THAP8Q8NA92 274 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 ARPC1AQ92747 370 aa7.19□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 PAX4O43316 350 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 IL19Q9UHD0 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.17□□□□□ -1.26
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PDPR-210ENST00000568530 OR51M1Q9H341 326 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 TET1Q8NFU7 2136 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPR-210ENST00000568530 VCX2Q9H322 139 aa7.16□□□□□ -1.26
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