RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 TNXAQ16473 311 aa13.75□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.75□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 OR13C8Q8NGS7 320 aa13.75□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 IGKV1-13P0DP09 117 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 FXYD4P59646 89 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 DEFB125Q8N687 156 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 COPZ2Q9P299 210 aa13.74□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZNF785A8K8V0 405 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 MPPED1O15442 326 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 NDUFB6O95139 128 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 PTTG1O95997 202 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 OR9G9P0C7N8 305 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 CD81P60033 236 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 TATDN3Q17R31 274 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 RPEL1Q2QD12 228 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 NEURL2Q9BR09 285 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 OR2A4O95047 310 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 CCR6P51684 374 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 RHOGP84095 191 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ENKURQ8TC29 256 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SECTM1Q8WVN6 248 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 PCLOQ9Y6V0 5065 aa13.72□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 FAM223BA6NKX1 122 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ACTL6BO94805 426 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 PRH1P02810 166 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 PGAM2P15259 253 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SPIN2AQ99865 258 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.71□□□□□ -0.21
INO80E-212ENST00000568043 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 BMPR1BO00238 502 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 GPR31O00270 319 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 FCGR3BO75015 233 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 RND3P61587 244 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 RGS21Q2M5E4 152 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 KCTD9Q7L273 389 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 DUSP18Q8NEJ0 188 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 PEMTQ9UBM1 199 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.7□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 IGLV2-14P01704 120 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 TCRBP04435 133 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 EDN2P20800 178 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 S100GP29377 79 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 GNRHRP30968 328 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 ATP5G2Q06055 141 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 NRARPQ7Z6K4 114 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 MMD2Q8IY49 270 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 GPR132Q9UNW8 380 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.69□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 OR11H12B2RN74 326 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 NECAP1Q8NC96 275 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 C5orf66Q9H5L9 145 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.68□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 TAS2R31P59538 309 aa13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 C15orf32Q32M92 178 aa13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 NUDT15Q9NV35 164 aa13.67□□□□□ -0.22
INO80E-212ENST00000568043 OR2J3O76001 311 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms