RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567123.1

CSK-208, Transcript of C-terminal Src kinase, human

TSL 4

Gene CSK, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSK-208	ENST00000567123	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	TGOLN2	O43493	480 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	TNFSF12	O43508	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	AQP4	P55087	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	UPK2	O00526	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	PTHLH	P12272	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	MYL9	P24844	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSK-208	ENST00000567123	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	FCGR2C	P31995	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TFPI2	P48307	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	GNG2	P59768	71 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	MSMO1	Q15800	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	THYN1	Q9P016	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SULT1C2	O00338	296 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	RTL8C	O15255	209 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	HPRT1	P00492	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ADM	P35318	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TAS2R31	P59538	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123		K7EMT4	169 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	NDUFA4	O00483	81 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SERPINE2	P07093	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	NQO2	P16083	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TMEM187	Q14656	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	PPY	P01298	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	FGF2	P09038	288 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	RNF2	Q99496	336 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	MUC4	Q99102	2169 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123		M0R2N4	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SCGN	O76038	276 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ARPC4	P59998	168 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123		Q6ZTC4	211 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123		Q8NAQ8	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	HRH4	Q9H3N8	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSK-208	ENST00000567123	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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