RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PLCE1	Q9P212	2302 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GZMB	P10144	247 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	AREG	P15514	252 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF114	Q8NC26	417 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	HINT2	Q9BX68	163 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	hADV38S2	A0JD32	116 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	UPK2	O00526	184 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TCF23	Q7RTU1	214 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCL13	Q99616	98 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559		C9JCJ5	164 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CD40	P25942	277 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DDT	P30046	118 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GNG10	P50151	68 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TEX38	Q6PEX7	206 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPRML	Q8N4K4	120 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	NUP37	Q8NFH4	326 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		15.08	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	OCC1	Q8TAD7	63 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35E1	Q96K37	410 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		15.08	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559		A8MXE2	369 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A6	P0DMU7	189 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A5	P0DMU8	189 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A7	P0DMV0	189 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	IGFBP2	P18065	325 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	OR5B3	Q8NH48	314 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	BET1L	Q9NYM9	111 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF1A	P19438	455 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		15.07	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		15.06	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00869	P0C866	280 aa		15.06	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf83	Q53S99	150 aa		15.06	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		15.06	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	PAX1	P15863	534 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	FAM27E3	Q08E93	113 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	REC114	Q7Z4M0	266 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	PNKD	Q8N490	385 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf144	Q96I85	54 aa		15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ 0
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087X0M5	115 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GX30	115 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	NABP2	Q9BQ15	211 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	IL36B	Q9NZH7	164 aa		15.05	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-16	P04430	117 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R45	P59539	299 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	FOXH1	O75593	365 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	MMP23A	O75900	390 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	APOA2	P02652	100 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB7	P17568	137 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF90	Q03938	601 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	PRO1933	Q9H354	126 aa		15.04	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	DYSF	O75923	2080 aa		15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	MYOD1	P15172	320 aa		15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	PSG5	Q15238	335 aa		15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	SSX2	Q16385	188 aa		15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	TNC	P24821	2201 aa		15.02	■□□□□ -0

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