RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.54□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 SHISA3A0PJX4 238 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 ZNF727A8MUV8 499 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 OR9G9P0C7N8 305 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 BIVMQ86UB2 503 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RBKSQ9H477 322 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 FBXL17Q9UF56 701 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 HELTA6NFD8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 DBX1A6NMT0 343 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 PAX5Q02548 391 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 TNFRSF9Q07011 255 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 TMEM42Q69YG0 159 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 UMAD1C9J7I0 102 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 IGHV2-5P01817 119 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 ORM1P02763 201 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RAG2P55895 527 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RNF138Q8WVD3 245 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.53□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 OR2T8A6NH00 312 aa6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 Q8TCH9 128 aa6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 V9GYH0 126 aa6.52□□□□□ -1.36
SENP1-210ENST00000552189 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 COMMD7Q86VX2 200 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 CHEK1O14757 476 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 CD55P08174 381 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 P2RY1P47900 373 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 FHL1Q13642 323 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MIDNQ504T8 468 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 BIN3Q9NQY0 253 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 F8P00451 2351 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 HTN3P15516 51 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MPZP25189 248 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 EMP1P54849 157 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 UCP3P55916 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 COQ2Q96H96 371 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C10orf142B7Z368 130 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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SENP1-210ENST00000552189 OXA1LQ15070 435 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 ASB13Q8WXK3 278 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 RAB5CP51148 216 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 CX3CL1P78423 397 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TEX45Q8NA69 505 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TP53RKQ96S44 253 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MT-ND4LP03901 98 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MELTFP08582 738 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 PAXXQ9BUH6 204 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MED12LQ86YW9 2145 aa6.51□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 C22orf46C9J442 243 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 SIAH2O43255 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 FOXL1Q12952 345 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 TMEM177Q53S58 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 DTX2Q86UW9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 H3BTX0 84 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 ZNF735P0CB33 412 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 EFNB1P98172 346 aa6.5□□□□□ -1.37
SENP1-210ENST00000552189 ZNF79Q15937 498 aa6.5□□□□□ -1.37
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