RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 BET1LQ9NYM9 111 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 UPK2O00526 184 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 RGS10O43665 173 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 SSX5O60225 188 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 CTXN2P0C2S0 81 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 OR13C7P0DN81 318 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 MFAP2P55001 183 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 HACD4Q5VWC8 232 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 ZNF773Q6PK81 442 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 CENPOQ9BU64 300 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 HINT2Q9BX68 163 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 APLNQ9ULZ1 77 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 RAB3BP20337 219 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 SSX1Q16384 188 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 OR4A5Q8NH83 315 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 MFFQ9GZY8 342 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 THYN1Q9P016 225 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 PKD1P98161 4303 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 F8W735 103 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 NDUFA4O00483 81 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 MYL9P24844 172 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 FCGR2CP31995 323 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 ADMP35318 185 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 RANBP1P43487 201 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 FXYD4P59646 89 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 GNG2P59768 71 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 WT1-ASQ06250 92 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 Q56UQ5 140 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 OR51H1Q8NH63 302 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 DUSP21Q9H596 190 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 TMEM140Q9NV12 185 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-227ENST00000551441 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 C22orf42Q6IC83 251 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SMPXQ9UHP9 88 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 NSG2Q9Y328 171 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CHEK1O14757 476 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 YIF1AO95070 293 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 IGHV3-48P01763 117 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SERPINE2P07093 398 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ARPC4P59998 168 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 LEMD1Q68G75 181 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 K7EMT4 169 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 EBAG9O00559 213 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 HPRT1P00492 218 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 NQO2P16083 231 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 AQP4P55087 323 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TAS2R31P59538 309 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ARL6IP1Q15041 203 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ETV7Q9Y603 341 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 K7EIM0 57 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 PPYP01298 95 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TMEM187Q14656 261 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TMEM17Q86X19 198 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 BEST4Q8NFU0 473 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 VCXQ9H320 206 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GVY2 172 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 C15orf62A8K5M9 175 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 M0R2N4 97 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CYB5BO43169 146 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CTSGP08311 255 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CATR1Q13166 79 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 PRSS48Q7RTY5 328 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms