RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 BPIFB3P59826 476 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 HBG2P69892 147 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 LILRB2Q8N423 598 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 NANPQ8TBE9 248 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 NPY1RP25929 384 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 BAP18Q8IXM2 172 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 STOML3Q8TAV4 291 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 ZNF266Q14584 549 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 IFNA5P01569 189 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 IFNA4P05014 189 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 OR13C7P0DN81 318 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 Q8N9W7 124 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 A0A1B0GW64 132 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 H3BUX3 64 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 FXYD3Q14802 87 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 LY6EQ16553 131 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf83Q53S99 150 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 REG1AP05451 166 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 WT1-ASQ06250 92 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 TEX22C9J3V5 150 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 CD5LO43866 347 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRR-209ENST00000549308 CX3CL1P78423 397 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 AANATQ16613 207 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 ARPC1AQ92747 370 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-209ENST00000549308 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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