RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 IL22RA2Q969J5 263 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM56Q96MV1 263 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RYR2Q92736 4967 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 G3V318 75 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SNAPC5O75971 98 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 BRI3O95415 125 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV1-40P01703 118 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TCRBP04435 133 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 P0C879 139 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ANXA3P12429 323 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMB8P28062 276 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 GNB1P62873 340 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SRPXP78539 464 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXE3Q13461 319 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TRIM16LQ309B1 348 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM219AQ8IW50 185 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LFNGQ8NES3 379 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SPIN2AQ99865 258 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 PRNDQ9UKY0 176 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 MSGN1A6NI15 193 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 C15orf61A6NNL5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX22C9J3V5 150 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 E7EUB6 86 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 H3BUA1 57 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SFT2D2O95562 160 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1-5P01602 117 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR9G9P0C7N8 305 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 AKR1C2P52895 323 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFA1P59665 94 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFA3P59666 94 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R1AQ13522 171 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ECSCRQ19T08 205 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RGS21Q2M5E4 152 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF429Q86V71 674 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LGI3Q8N145 548 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LRTM2Q8N967 370 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5B3Q8NH48 314 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0B4J2A0 478 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1B0GW64 132 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PN81 502 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 CGB1A6NKQ9 187 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SOX15O60248 233 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4E1P0C645 316 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 VAMP1P23763 118 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 CHRNA7P36544 502 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2B8PP59922 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 AARDQ4LEZ3 155 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4A16Q8NH70 328 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 PHB2Q99623 299 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 NUDT15Q9NV35 164 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 NSG2Q9Y328 171 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0B4J293 547 aa6.71□□□□□ -1.34
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