RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-208	ENST00000538923	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	CRHBP	P24387	322 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF585B	Q52M93	769 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	OR4A5	Q8NH83	315 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	THYN1	Q9P016	225 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	SPATA2	Q9UM82	520 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	CYB5B	O43169	146 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	RGS10	O43665	173 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	REG1A	P05451	166 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	HLA-G	P17693	338 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	MYL9	P24844	172 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	GPR183	P32249	361 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	OR10A3	P58181	314 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	CDNF	Q49AH0	187 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	HACD4	Q5VWC8	232 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	CNIH2	Q6PI25	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	PLET1	Q6UQ28	207 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	RNF183	Q96D59	192 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	MGLL	Q99685	303 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	DUSP21	Q9H596	190 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRE11-208	ENST00000538923	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923		B5MCH6	92 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TSPAN4	O14817	238 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	RAB3B	P20337	219 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	SSX9	Q7RTT3	188 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	BET1L	Q9NYM9	111 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	OR4C46	A6NHA9	309 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	CGB1	A6NKQ9	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	DEDD	O75618	318 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	SCGN	O76038	276 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	FGF2	P09038	288 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	OR2B8P	P59922	312 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	MSMO1	Q15800	293 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	GALNT14	Q96FL9	552 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TMEM235	A6NFC5	223 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TGOLN2	O43493	480 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TNFSF12	O43508	249 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	TAS2R31	P59538	309 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	GNG2	P59768	71 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ARPC4	P59998	168 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MRE11-208	ENST00000538923	MFF	Q9GZY8	342 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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