RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 GCGP01275 180 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SLC25A16P16260 332 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ATP6V0CP27449 155 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 GDF1P27539 372 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PTGDSP41222 190 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 CLDN17P56750 224 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 DSCR9P59020 149 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ATP6V1FQ16864 119 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 NMSQ5H8A3 153 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 Q75L30 129 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 NEUROG1Q92886 237 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 EMC6Q9BV81 110 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 WFDC1Q9HC57 220 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 DOK5Q9P104 306 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SYNGR3O43761 229 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 CBR3O75828 277 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TRAPPC6AO75865 159 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 NAPSAO96009 420 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 LCATP04180 440 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 FGF7P21781 194 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 GABRR1P24046 479 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HTD2P86397 168 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 MKXQ8IYA7 352 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SLC35G3Q8N808 338 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 STARD4Q96DR4 205 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 REEP6Q96HR9 211 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 FAM210BQ96KR6 192 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SPACA5Q96QH8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 IMMP2LQ96T52 175 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 VAX2Q9UIW0 290 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 NCKAP5O14513 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SMCO3A2RU48 225 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 PPP5D1E7EU14 171 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 F5H5K5 113 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 H0YL77 283 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BKO60814 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BJP06899 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR13C7P0DN81 318 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 BCL2P10415 239 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 AADACP22760 399 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BOP23527 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BBP33778 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BDP58876 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR2B8PP59922 312 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BCP62807 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 LCN2P80188 198 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ZNF92Q03936 586 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 Q3ZCU0 254 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 THAP8Q8NA92 274 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 DDB2Q92466 427 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TOMM40LQ969M1 308 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 ISOC2Q96AB3 205 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-216ENST00000537568 TMEM45BQ96B21 275 aa6.49□□□□□ -1.37
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