RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP57	Q9NU63	452 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-224	ENST00000534730	THYN1	Q9P016	225 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-224	ENST00000534730	CACNG5	Q9UF02	275 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-224	ENST00000534730	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FBXO24	O75426	580 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	IGHG4	P01861	327 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HOXB5	P09067	269 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PRCD	Q00LT1	54 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	AARD	Q4LEZ3	155 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	GPR146	Q96CH1	333 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0G2JLM5	398 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	DEFA4	P12838	97 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZS46	218 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF747	Q9BV97	191 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0B4J293	547 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ST8SIA3	O43173	380 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SSNA1	O43805	119 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SNCA	P37840	140 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NDP	Q00604	133 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OXA1L	Q15070	435 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TATDN3	Q17R31	274 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NSG2	Q9Y328	171 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TG	P01266	2768 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CORT	O00230	105 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	WRB	O00258	174 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CRYGC	P07315	174 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PSMB6	P28072	239 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PF4V1	P10720	104 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HTR2B	P41595	481 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CFHR3	Q02985	330 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730		G3V318	75 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CTRB1	P17538	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	PSMB8	P28062	276 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-224	ENST00000534730	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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