RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 RCN3Q96D15 328 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CLCC1Q96S66 551 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 APOL4Q9BPW4 351 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TOLLIPQ9H0E2 274 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 WFDC10AQ9H1F0 79 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHA1Q9HB21 404 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 HES4Q9HCC6 221 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 FAM206AQ9NX38 181 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CMTM6Q9NX76 183 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CALYQ9NYX4 217 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 PIPOXQ9P0Z9 390 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CD300AQ9UGN4 299 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 PSG11Q9UQ72 335 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.29□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 BBIP1A8MTZ0 92 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 OR11H12B2RN74 326 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 H3BN98 237 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 M0R2N4 97 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 WRBO00258 174 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 NME4O00746 187 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ENTPD6O75354 484 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 DHRS3O75911 302 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 SCGNO76038 276 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CCNB2O95067 398 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 IGLV1-51P01701 117 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TTRP02766 147 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TRGV3P03979 118 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 FABP3P05413 133 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CD7P09564 240 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 IL3RAP26951 378 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ERP29P30040 261 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 HTR1FP30939 366 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEA2P43356 314 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 KIR2DS2P43631 304 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CDKN1BP46527 198 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 SYNJ2BPP57105 145 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TPPP2P59282 170 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 RUNX1Q01196 453 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 MMDQ15546 238 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 LINC01590Q5TEZ4 76 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 LCN12Q6JVE5 192 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 Q8N402 240 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 YIPF7Q8N8F6 280 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF565Q8N9K5 539 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 OR5D18Q8NGL1 313 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 OTOSQ8NHW6 89 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35E1Q96K37 410 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 C7orf34Q96L11 122 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 NICN1Q9BSH3 213 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 MROQ9BYG7 248 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 TMBIM4Q9HC24 238 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 KIF25Q9UIL4 384 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 AP3M1Q9Y2T2 418 aa2.28□□□□□ -2.04
CLVS1-209ENST00000522928 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.28□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1B0GTI1 187 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 SNTNA6NMZ2 147 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 E2F6O75461 281 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 NPPAP01160 153 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA4P05014 189 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CRYGBP07316 175 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CD1BP29016 333 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CD40LGP29965 261 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 BMI1P35226 326 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 SSTR5P35346 364 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 RBP2P50120 134 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 CDC42P60953 191 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 PSME3P61289 254 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 DEFA5Q01523 94 aa2.27□□□□□ -2.05
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF9Q07011 255 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms