RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 DEFB108BQ8NET1 73 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR4A4PQ8NGN8 299 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR13C2Q8NGS9 318 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR2T29Q8NH02 315 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR51A7Q8NH64 312 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 PFN4Q8NHR9 129 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 PIGXQ8TBF5 258 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM239Q8WW34 195 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 RASSF5Q8WWW0 418 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM234Q8WY98 164 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 DDIT4LQ96D03 193 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MUCL1Q96DR8 90 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SGTBQ96EQ0 304 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 KCNS1Q96KK3 526 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 EMC6Q9BV81 110 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TAPBPLQ9BX59 468 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 DUSP21Q9H596 190 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF442Q9H7R0 627 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 BEX1Q9HBH7 125 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ARMC1Q9NVT9 282 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 EMC3Q9P0I2 261 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TMCC3Q9ULS5 477 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MUC4Q99102 2169 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 LYSTQ99698 3801 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.56□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 DNAH7Q8WXX0 4024 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TRAV27A0A087WT01 109 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 EFCAB9A8MZ26 197 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CENPBD1B2RD01 187 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 B4DSR2 109 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 G3V2T6 193 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 M0R233 179 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 FAAHO00519 579 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 PLPP3O14495 311 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CDC42EP2O14613 210 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 RNF13O43567 381 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CHP2O43745 196 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR2T1O43869 369 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 E2F6O75461 281 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 FCN3O75636 299 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CCNB2O95067 398 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR5F1O95221 314 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SOX14O95416 240 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 AHSA1O95433 338 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ATP6V1G2O95670 118 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 HLA-HP01893 362 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CCL2P13500 99 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 HTR1DP28221 377 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SRP14P37108 136 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEA2P43356 314 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 GPR4P46093 362 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OMPP47874 163 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 HCCSP53701 268 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM11AP58511 58 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35A1P78382 337 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 IFITM3Q01628 133 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 GLO1Q04760 184 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 PMS2P3Q13401 168 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 C1DQ13901 141 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 RCN1Q15293 331 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CEACAM16Q2WEN9 425 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ALKBH6Q3KRA9 238 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CARD17Q5XLA6 110 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35D2Q76EJ3 337 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 AAED1Q7RTV5 226 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CLDN22Q8N7P3 220 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 C3orf56Q8N813 242 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR5J2Q8NH18 312 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR4K13Q8NH42 304 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR5K1Q8NHB7 308 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MFSD8Q8NHS3 518 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35B4Q969S0 331 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 PRRC1Q96M27 445 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 Q96M85 177 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 CIB1Q99828 191 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TSSK6Q9BXA6 273 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TOLLIPQ9H0E2 274 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 OR51B6Q9H340 312 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 RERGLQ9H628 205 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 REEP1Q9H902 201 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 DYNLRB1Q9NP97 96 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MED29Q9NX70 200 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 TVP23BQ9NYZ1 205 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 MED31Q9Y3C7 131 aa1.55□□□□□ -2.16
CPEB4-210ENST00000522344 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms