RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 COL4A5P29400 1685 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RTL9Q8NET4 1388 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-DQB2P05538 268 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 COL8A2P25067 703 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HTR4Q13639 388 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RASL11AQ6T310 242 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR11H1Q8NG94 326 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC42Q96M95 316 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC37AA6NMS7 1700 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF292O60281 2723 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CDS2O95674 445 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNA16P05015 189 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A16P16260 332 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10A6Q8NH74 314 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MGLLQ99685 303 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf95Q9H693 158 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRJQ12913 1337 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C17orf98A8MV24 154 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 LY6HO94772 140 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNC2P02585 160 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 NPPCP23582 126 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CRYBB3P26998 211 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FADDQ13158 208 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDX4Q13162 271 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 BATFQ16520 125 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF550Q7Z398 422 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX12Q9UMY4 172 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PNM2 257 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 DHRS12A0PJE2 317 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TP53I11O14683 189 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CCL5P13501 91 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 UCHL3P15374 230 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CCL1P22362 96 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 BTN3A2P78410 334 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2F1Q13607 317 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2T27Q8NH04 317 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4K13Q8NH42 304 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 DUOX1Q9NRD9 1551 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR6C6A6NF89 314 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 APOMO95445 188 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SOD1P00441 154 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 P0C880 135 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB5BP61020 215 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXC5Q00444 222 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST3H3Q16695 136 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 AMTNQ6UX39 209 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR119Q8TDV5 335 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM186AA6NE01 2351 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PSME4Q14997 1843 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 USP24Q9UPU5 2620 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 DISC1C4P0D8 188 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC17A3O00476 420 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 LPAR6P43657 344 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 MARCKSL1P49006 195 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP10-10P60014 251 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 CACNA1HO95180 2353 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 CCL3P10147 92 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINB10P48595 397 aa3.89□□□□□ -1.79
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