RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 KIR2DS2P43631 304 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 BPIFB3P59826 476 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF726P1Q15940 193 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RPEQ96AT9 228 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A087WWC5 75 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 LGALS4P56470 323 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNL4K9M1U5 179 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GCHFRP30047 84 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GLRXP35754 106 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CD81P60033 236 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MLANAQ16655 118 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 NPIPB3Q92617 1050 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP210LQ5VU65 1888 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CSN3P07498 182 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 FOLR2P14207 255 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 DDTP30046 118 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MIR17HGQ75NE6 70 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SFRP2Q96HF1 295 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 VAMP8Q9BV40 100 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GV90 55 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PKIAP61925 76 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZR03 302 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 C1QL4Q86Z23 238 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RND2P52198 227 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MFAP2P55001 183 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF714Q96N38 554 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 GP6Q9HCN6 339 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IL19Q9UHD0 177 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 INSIG2Q9Y5U4 225 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 J3QW42 95 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF137PP52743 207 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 STARD4Q96DR4 205 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MPDU1O75352 247 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PAX6P26367 422 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CD82P27701 267 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PAX5Q02548 391 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CHEK1O14757 476 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZS49 121 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MOSP00540 346 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CEACAM1P13688 526 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 NUBP1P53384 320 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-DRB5Q30154 266 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 LYNX1P0DP58 116 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TREML4Q6UXN2 200 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR31Q8NA23 367 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 S4R3C0 116 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GUS0 222 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 26.2
RABGEF1-211ENST00000503687 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OR9G1Q8NH87 305 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 OCC1Q8TAD7 63 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 HILPDAQ9Y5L2 63 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-211ENST00000503687 CD40P25942 277 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms