RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 NXPH3O95157 252 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHG4P01861 327 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TRGV3P03979 118 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 ELANEP08246 267 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 AREGP15514 252 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CFHR3Q02985 330 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 DHRS2Q13268 280 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM219AQ8IW50 185 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.48□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 ENY2Q9NPA8 101 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNG5Q9UF02 275 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0B4J2A0 478 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0G2JRQ6 117 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 DHFRP00374 187 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PRH1P02810 166 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 FGF2P09038 288 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXB5P09067 269 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13C7P0DN81 318 aa10.47□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5B3Q8NH48 314 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1S1Q8NH92 325 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 GPR146Q96CH1 333 aa10.47□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.46□□□□□ -0.73
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PGGT1B-204ENST00000503638 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CD83Q01151 205 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFA5Q01523 94 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CYB5BO43169 146 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV1-40P01703 118 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-11P01762 117 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMB6P28072 239 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SMCO1Q147U7 214 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE2CQ5TA81 110 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CADM3Q8N126 398 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4F4Q96R69 305 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP57Q9NU63 452 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 TGP01266 2768 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 TNCP24821 2201 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GW64 132 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 CGB1A6NKQ9 187 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM25EA8MYX2 175 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BUA1 57 aa10.44□□□□□ -0.74
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