RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 E7EUB6 86 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 H3BUA1 57 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OVOL1O14753 267 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCRBP04435 133 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR9G9P0C7N8 305 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 P0C879 139 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LPAR6P43657 344 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR4A47Q6IF82 309 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM68Q96MH6 324 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPIN2AQ99865 258 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PALMDQ9NP74 551 aa9.33□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDS2O95674 445 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR5AC1P0C628 307 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NQO2P16083 231 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RHOGP84095 191 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM187Q14656 261 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SP6Q3SY56 376 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SEC22AQ96IW7 307 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM56Q96MV1 263 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRR25Q96S07 402 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BET1LQ9NYM9 111 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.32□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0G2JLM5 398 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A1B0GW64 132 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MARCH11A6NNE9 402 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TEX22C9J3V5 150 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAP30O75446 220 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LY86O95711 162 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRBV12-3P01733 135 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 REG1AP05451 166 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FGF2P09038 288 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AKR1C4P17516 323 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HLA-GP17693 338 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R1AQ13522 171 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.31□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TGP01266 2768 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR2J3O76001 311 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SFT2D2O95562 160 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGKV1-5P01602 117 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SERPINE2P07093 398 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AREGP15514 252 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAS1LP35410 378 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DEFA1P59665 94 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DEFA3P59666 94 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERVK-16P61578 105 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP5G2Q06055 141 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR4A5Q8NH83 315 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IL22RA2Q969J5 263 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USMG5Q96IX5 58 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM140Q9NV12 185 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NUDT15Q9NV35 164 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.3□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C9orf170A2RU37 121 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CGB1A6NKQ9 187 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UPK2O00526 184 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRASP01116 189 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 G6PCP35575 357 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DHRS2Q13268 280 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRTM2Q8N967 370 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NSG2Q9Y328 171 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 S4R3C0 116 aa9.29□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.28□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.28□□□□□ -0.92
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A0G2JRQ6 117 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms