RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	RPA2	P15927	270 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	G6PC	P35575	357 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-208	ENST00000495327	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		H0Y980	276 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		H3BMQ9	156 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	LGALS9	O00182	355 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CTDSPL	O15194	276 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CYB5B	O43169	146 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SNAPC5	O75971	98 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SERPINE2	P07093	398 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		Q8N402	240 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	THYN1	Q9P016	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		A8MWP6	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	RAB3D	O95716	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PGAM2	P15259	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ARL3	P36405	182 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PPP5C	P53041	499 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PIGP	P57054	158 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	IL18	Q14116	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MEF2D	Q14814	521 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		Q8N1Y9	231 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ATP6V0B	Q99437	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		S4R3C0	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		A8MZ25	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	B3GALNT1	O75752	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR2C1	O95371	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PI3	P19957	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327		P0C879	139 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	GPR183	P32249	361 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MFAP2	P55001	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF114	Q8NC26	417 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-208	ENST00000495327	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms