RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 FAM210AQ96ND0 272 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR51J1Q9H342 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C16orf95Q9H693 158 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 PARP11Q9NR21 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 PRNDQ9UKY0 176 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NSG2Q9Y328 171 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NF1P21359 2839 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 A0A0G2JRQ6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 LINC01548A6NM66 108 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C15orf61A6NNL5 157 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NUDT19A8MXV4 375 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 AP4M1O00189 453 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ATP6V0E1O15342 81 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OPN1MWP04001 364 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FGF2P09038 288 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR2B8PP59922 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NDPQ00604 133 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FOXL1Q12952 345 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TATDN3Q17R31 274 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NMSQ5H8A3 153 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SPIN2AQ99865 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 CACNG5Q9UF02 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 A0A0B4J293 547 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1B0GU03 582 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1B0GUS0 222 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM89A2RUT3 159 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C7orf66A4D0T2 115 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 MSGN1A6NI15 193 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SSNA1O43805 119 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ADAP1O75689 374 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 IGF1P05019 195 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 MYOD1P15172 320 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SMCO1Q147U7 214 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ECSCRQ19T08 205 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 Q6ZRM9 215 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 STPG2Q8N412 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR5B3Q8NH48 314 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 OR1S1Q8NH92 325 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 LINC01006Q8NI28 216 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 HINT2Q9BX68 163 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ALG5Q9Y673 324 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 PSMB11A5LHX3 300 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 FAM25EA8MYX2 175 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ST8SIA3O43173 380 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 IFNA17P01571 189 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SLC25A6P12236 298 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 SLC35B1P78383 322 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF429Q86V71 674 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-210ENST00000491203 LFNGQ8NES3 379 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms