RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB1C	Q92928	201 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPE3	182 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPR1	153 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C2Y5	167 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QL1	O75973	258 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	KBTBD11	O94819	623 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NXPH3	O95157	252 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYZL1	O95825	349 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MB	P02144	154 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GNLY	P22749	145 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MC5R	P33032	325 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS7	P47929	136 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FHIT	P49789	147 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	GNG10	P50151	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SVBP	Q8N300	66 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF5	Q99942	180 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DSCAM	O60469	2012 aa		4.46	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.46	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ARID1A	O14497	2285 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPE2	198 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PR64	198 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PRV1	198 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247		C9JQL5	133 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA17	P01571	189 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PRH1	P02810	166 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPF	P07098	398 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYGB	P07316	175 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PRTN3	P24158	256 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PAX6	P26367	422 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	EFNA4	P52798	201 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRX1	P54821	245 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2B8P	P59922	312 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB11A	P62491	216 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	RUNX1	Q01196	453 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PAX2	Q02962	417 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	FHL3	Q13643	280 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	PEA15	Q15121	130 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	GUK1	Q16774	197 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ATG4A-208	ENST00000489247	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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