RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485939.5

BBX-225, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-225	ENST00000485939	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MYL12B	O14950	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	CD1A	P06126	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	RRAS	P10301	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	GAL	P22466	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	SERPINB10	P48595	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	OR10A3	P58181	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	TAS2R43	P59537	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MED22	Q15528	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBX-225	ENST00000485939	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		K7EIM0	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CHEK1	O14757	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CDK1	P06493	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	FCER2	P06734	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DEFA4	P12838	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HLA-G	P17693	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PPP5C	P53041	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DEFB131A	P59861	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939		Q6ZR54	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68	4e-10	■■■□□ 18.8
BBX-225	ENST00000485939	TPBG	Q13641	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TMEM187	Q14656	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBX-225	ENST00000485939	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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