RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CD5LO43866 347 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FCGR3BO75015 233 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV1-47P01700 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-69P01742 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBP04435 133 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RPA2P15927 270 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1C4P17516 323 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TBPP20226 339 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GNRHRP30968 328 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SAA4P35542 130 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRRX1P54821 245 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DEFA1P59665 94 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DEFA3P59666 94 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SP6Q3SY56 376 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD9Q7L273 389 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MOB3BQ86TA1 216 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DRAM1Q8N682 238 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR51H1Q8NH63 302 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 UPRTQ96BW1 309 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V0BQ99437 205 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRRT1Q99946 306 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RAB9BQ9NP90 201 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT15Q9NV35 164 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF221Q9UK13 617 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GPR132Q9UNW8 380 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ODF3BA8MYP8 253 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LY6LH3BQJ8 138 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GPR31O00270 319 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB6O95139 128 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RBP4P02753 201 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A6P0DMU7 189 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A5P0DMU8 189 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A7P0DMV0 189 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HTR1DP28221 377 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CD34P28906 385 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A1P30531 599 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2E1P51965 193 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PIGPP57054 158 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RGS21Q2M5E4 152 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM16LQ309B1 348 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GPR157Q5UAW9 335 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF383Q8NA42 475 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF596Q8TC21 504 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM230Q96A57 120 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PALMDQ9NP74 551 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 COPZ2Q9P299 210 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CREBBPQ92793 2442 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GVG6 124 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LEUTXA8MZ59 168 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 H7C2Y5 167 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 J3QLI3 93 aa3.73□□□□□ -1.81
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