RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CGAP01215 116 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 GABRA6Q16445 453 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 PMCHL2Q9BQD1 86 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 ZPBPQ9BS86 351 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.51□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FOXH1O75593 365 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TFF1P04155 84 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MFAP2P55001 183 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 OR8B2Q96RD0 313 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 LYZL6O75951 148 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CA7P43166 264 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FZR1Q9UM11 496 aa13.5□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 RRHO14718 337 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 IGLL1P15814 213 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 UQCRFS1P47985 274 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS4P56470 323 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 Q5PR19 223 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CORO2AQ92828 525 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TOX4O94842 621 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CXorf1O96002 111 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 NIT1Q86X76 327 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 OR4A16Q8NH70 328 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 K7ERU9 68 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TMPRSS2O15393 492 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MT-CO2P00403 227 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SP9P0CG40 484 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CCL11P51671 97 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TNXAQ16473 311 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TSKUQ8WUA8 353 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SGK494Q96LW2 274 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 PSG11Q9UQ72 335 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 M0R1X1 148 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FCGR3BO75015 233 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 RPL8P62917 257 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM21Q3KPI0 293 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MDP1Q86V88 176 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 hDV102S1A0JD36 115 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CD59P13987 128 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 WDR73Q6P4I2 378 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SP1P08047 785 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 EDDM3AQ14507 147 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CDIPTO14735 213 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 GCHFRP30047 84 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MUC21Q5SSG8 566 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 GALMQ96C23 342 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 CTRLP40313 264 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 Q0VG73 95 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 STPG3Q8N7X2 389 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 OR2H2O95918 312 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 AESQ08117 197 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 IL19Q9UHD0 177 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 M0R296 226 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 BMPR1BO00238 502 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 FABP6P51161 128 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 GNG3P63215 75 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-204ENST00000483092 GOSR1O95249 250 aa13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2G1P62253 170 aa13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZSR3 168 aa13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 POM121L2Q96KW2 1035 aa13.46□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 PCNX1Q96RV3 2341 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 AGFG2O95081 481 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.45□□□□□ -0.26
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.7 ms