RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TGOLN2O43493 480 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RPA2P15927 270 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR2CP31995 323 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R31P59538 309 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ARPC4P59998 168 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 MSMO1Q15800 293 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 POU2AF1Q16633 256 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF773Q6PK81 442 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 STPG3Q8N7X2 389 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2T8A6NH00 312 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGNO76038 276 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PPYP01298 95 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NQO2P16083 231 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 WT1-ASQ06250 92 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 BEST4Q8NFU0 473 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM140Q9NV12 185 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 THYN1Q9P016 225 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4C46A6NHA9 309 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 F8W735 103 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HPRT1P00492 218 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF2P09038 288 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR13C7P0DN81 318 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 MFAP2P55001 183 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FXYD4P59646 89 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HOGA1Q86XE5 327 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5B3Q8NH48 314 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51H1Q8NH63 302 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CNBD2Q96M20 576 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXL17Q9UF56 701 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFA4O00483 81 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CYB5BO43169 146 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FCER2P06734 321 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINE2P07093 398 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ADMP35318 185 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CATR1Q13166 79 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM17Q86X19 198 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GALNT14Q96FL9 552 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HINT2Q9BX68 163 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 COMMD9Q9P000 198 aa6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EIM0 57 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EMT4 169 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMB9P28065 219 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SDC2P34741 201 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF124Q15973 351 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.91□□□□□ -1.3
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