RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 ZFP82Q8N141 532 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 IL22RA2Q969J5 263 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 RHOVQ96L33 236 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 S100A6P06703 90 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 AGPAT2O15120 278 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 OPN1MWP04001 364 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 MAS1LP35410 378 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 MIDNQ504T8 468 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 CFHR4Q92496 578 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 HARBI1Q96MB7 349 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM140Q9NV12 185 aa14.53□□□□□ -0.08
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ATG4B-217ENST00000475693 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 AWAT1Q58HT5 328 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 OR4A47Q6IF82 309 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 SMR3AQ99954 134 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-217ENST00000475693 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.095e-6■■□□□ 12.1
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ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1-33P01594 117 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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ATG4B-217ENST00000475693 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 FABP1P07148 127 aa14.47□□□□□ -0.09
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ATG4B-217ENST00000475693 GATA3P23771 443 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF616Q08AN1 781 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 WFDC1Q9HC57 220 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-217ENST00000475693 UMAD1C9J7I0 102 aa14.47□□□□□ -0.09
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