RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OR2T8A6NH00 312 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 KRT75O95678 551 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OTCP00480 354 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CSN1S1P47710 185 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 WFDC11Q8NEX6 87 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OR7G1Q8NGA0 311 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OR10D3Q8NH80 312 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 STOML3Q8TAV4 291 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 JPT1Q9UK76 154 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 NCOR1O75376 2440 aa-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CITO14578 2027 aa-1.1□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RAB19A4D1S5 217 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 IGLV3-1P01715 115 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 MIFP14174 115 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 LRRC26Q2I0M4 334 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 OOSP2Q86WS3 158 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TBC1D19Q8N5T2 526 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 MROQ9BYG7 248 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RASL12Q9NYN1 266 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ANK2Q01484 3957 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-1.1□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 C5orf49A4QMS7 147 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 IFITM1P13164 125 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 OR4D1Q15615 310 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 DEFB128Q7Z7B8 93 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TMEM251Q8N6I4 163 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SPACA1Q9HBV2 294 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ENPP5Q9UJA9 477 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TMEM94Q12767 1356 aa-1.11□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 F8P00451 2351 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ACANP16112 2415 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 YEATS4O95619 227 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ZNF137PP52743 207 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 OR4D2P58180 307 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ATOH7Q8N100 152 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ITFG2Q969R8 447 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 METTL9Q9H1A3 318 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 HRASLSQ9HDD0 168 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 A0A1W2PP64 1363 aa-1.12□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 FAT1Q14517 4588 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SULT1C2O00338 296 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 FGF6P10767 208 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RAB13P51153 203 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RHOGP84095 191 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SPRNQ5BIV9 151 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 C6orf52Q5T4I8 152 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SYPL2Q5VXT5 272 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 Q6ZQT0 140 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 OR5B17Q8NGF7 314 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TMEM106AQ96A25 262 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 PPCDCQ96CD2 204 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 BBS2Q9BXC9 721 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 HERC2O95714 4834 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 LAMA5O15230 3695 aa-1.13□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 CCL25O15444 150 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 FADS2O95864 444 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 HTR1AP08908 422 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SLC35E2BP0CK96 405 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 CXCL2P19875 107 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 S100A7P31151 101 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 STX5Q13190 355 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 C1orf137Q5JT78 98 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 SLC22A4Q9H015 551 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 HES4Q9HCC6 221 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 GPR84Q9NQS5 396 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 AK3Q9UIJ7 227 aa-1.14□□□□□ -2.59
SSB-208ENST00000468600 CFAP45Q9UL16 551 aa-1.14□□□□□ -2.59
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