RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 MAS1LP35410 378 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SRPXP78539 464 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXL1Q12952 345 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ECSCRQ19T08 205 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZRM9 215 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 STPG2Q8N412 459 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 LRTM2Q8N967 370 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4A16Q8NH70 328 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 COQ8AQ8NI60 647 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 PHB2Q99623 299 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFHX3Q15911 3703 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CUBNO60494 3623 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0B4J2A0 478 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GW64 132 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 HMX3A6NHT5 357 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 C15orf61A6NNL5 157 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 AP4M1O00189 453 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 NXPH3O95157 252 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 DHFRP00374 187 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 IGF1P05019 195 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 VDAC1P21796 283 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 PROK1P58294 105 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP10-3P60369 221 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 AWAT1Q58HT5 328 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SPINK9Q5DT21 86 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF329Q86UD4 541 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM219AQ8IW50 185 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CADM3Q8N126 398 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 LFNGQ8NES3 379 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5T1Q8NG75 326 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 MITD1Q8WV92 249 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 HINT2Q9BX68 163 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNG5Q9UF02 275 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 PRNDQ9UKY0 176 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GUS0 222 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMB11A5LHX3 300 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX22C9J3V5 150 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CCSO14618 274 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ST8SIA3O43173 380 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 PRAF2O60831 178 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 REG1AP05451 166 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 SMCO1Q147U7 214 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OXA1LQ15070 435 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 NMSQ5H8A3 153 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1S1Q8NH92 325 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG5Q9Y673 324 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-208ENST00000463533 COL6A5A8TX70 2615 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PN81 502 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 MPTX1A8MV57 137 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX15O60248 233 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNA21P01568 189 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 IFNA17P01571 189 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 CD28P10747 220 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 AREGP15514 252 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-208ENST00000463533 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms