RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DBX1A6NMT0 343 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGOLN2O43493 480 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF2P09038 288 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 NQO2P16083 231 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAT1P18440 290 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CATR1Q13166 79 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51H1Q8NH63 302 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXorf58Q96LI9 332 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 COMMD9Q9P000 198 aa6.28□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF320A2RRD8 509 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 MARCH11A6NNE9 402 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EIM0 57 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 XRCC3O43542 346 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHFRP00374 187 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 RLN1P04808 185 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINE2P07093 398 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 F2RP25116 425 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 RFX2P48378 723 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEDD8Q15843 81 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL17DQ8TAD2 202 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOB3AQ96BX8 217 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 EHFQ9NZC4 300 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 NSG2Q9Y328 171 aa6.27□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-39P01597 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1D-39P04432 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR13C7P0DN81 318 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFA4P12838 97 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBX5P45973 191 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R20P59543 309 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLET1Q6UQ28 207 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 CADM3Q8N126 398 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 MARC2Q969Z3 335 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 YIPF6Q96EC8 236 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIABLOQ9NR28 239 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2T8A6NH00 312 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN4O14817 238 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM127O75204 238 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 JTBO76095 146 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMP2P02689 132 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 G6PCP35575 357 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPAR6P43657 344 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF124Q15973 351 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE2CQ5TA81 110 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPX8Q8TED1 209 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.25□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 NACAE9PAV3 2078 aa6.24□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0J9YWU9 116 aa6.24□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 C15orf61A6NNL5 157 aa6.24□□□□□ -1.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 I3L2K1 104 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259.1 ms