RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 APELAP0DMC3 54 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 DHODHQ02127 395 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 DHRS2Q13268 280 aa9.01□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 OR4S2Q8NH73 311 aa9.01□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 OR4C12Q96R67 309 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 C7orf66A4D0T2 115 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 LINC01619G3V211 115 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 ACTL6BO94805 426 aa9□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 ACSM6Q6P461 480 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 MSGN1A6NI15 193 aa8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 LPAR6P43657 344 aa8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-210ENST00000442481 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 MED28Q9H204 178 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.96□□□□□ -0.97
PRAME-210ENST00000442481 A0A0B4J2A0 478 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-210ENST00000442481 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-210ENST00000442481 B3GALNT1O75752 331 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-210ENST00000442481 KBTBD11O94819 623 aa8.96□□□□□ -0.98
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