RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PEX7O00628 323 aa5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 MARVELD3Q96A59 401 aa5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 RPRMQ9NS64 109 aa5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 IL36BQ9NZH7 164 aa5.71□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 RND3P61587 244 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CACNA1HO95180 2353 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ERGP11308 486 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LIMS1P48059 325 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 FOXS1O43638 330 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CDK2AP2O75956 126 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ICAM4Q14773 271 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 Q96M66 194 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 DPM3Q9P2X0 92 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CRPP02741 224 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CD69Q07108 199 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NPIPB3Q92617 1050 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 VGLL1Q99990 258 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NKX2-8O15522 239 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 Q6ZT83 130 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 PPBPP02775 128 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TMEM54Q969K7 222 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LRP5O75197 1615 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 C9JCJ5 164 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TAF1LQ8IZX4 1826 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GV90 55 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 M0R381 172 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SLC17A3O00476 420 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ZG16O60844 167 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 C5orf30Q96GV9 206 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 A0A087WWC5 75 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 IL9P15248 144 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 KLK2P20151 261 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NRN1LQ496H8 165 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 COL18A1P39060 1754 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ZAR1Q86SH2 424 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ARPC1AQ92747 370 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 GGTLC3B5MD39 225 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TEX45Q8NA69 505 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.69□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 H0YL77 283 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 CD8AP01732 235 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 REG1AP05451 166 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LY6EQ16553 131 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LY75O60449 1722 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LEPP41159 167 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 TMEM42Q69YG0 159 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 STHQ8IWL8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 DRAM1Q8N682 238 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.68□□□□□ -1.5
USP46-201ENST00000441222 LINC01587Q99440 93 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms