RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 IFNA4P05014 189 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 TREML4Q6UXN2 200 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 DTX2Q86UW9 622 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMD4Q96H15 378 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 OR8B2Q96RD0 313 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-202ENST00000435136 PRRX1P54821 245 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 BSXQ3C1V8 233 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MANBALQ9NQG1 85 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R036 132 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf83Q53S99 150 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CENPEQ02224 2701 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PPE2 198 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PR64 198 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PRV1 198 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CA2P00918 260 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LGALS7P47929 136 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PN81 502 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP92A6NM28 416 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LYNX1G3V0Z9 82 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf84I3L1E1 186 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV1-47P01700 117 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LYNX1P0DP58 116 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CHRNA7P36544 502 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB31Q13636 194 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A087WWC5 75 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SMCO3A2RU48 225 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BQ15 152 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TEPPQ6URK8 271 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB24Q969Q5 203 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MGST2Q99735 147 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC25A22Q9H936 323 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMB3P49720 205 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TVP23CQ96ET8 276 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 B4DEV8 164 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV2-23P01705 113 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FOLR2P14207 255 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 COLCA2A8K830 154 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 LIPFP07098 398 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 CHODLQ9H9P2 273 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM250H0YL14 139 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 REG1BP48304 166 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 HINT2Q9BX68 163 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2-202ENST00000435136 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 AVPI1Q5T686 147 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 TEX45Q8NA69 505 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 YIF1AO95070 293 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 SOD3P08294 240 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF212Q495C1 297 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 MT-ND4LP03901 98 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 MYOD1P15172 320 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 MAS1LP35410 378 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms