RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGFBP2P18065 325 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CA7P43166 264 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP5G3P48201 142 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LY6DQ14210 128 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H0YJW9 148 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UPK2O00526 184 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACTL6BO94805 426 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF212Q495C1 297 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KBTBD11O94819 623 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAX6P26367 422 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YPEL4Q96NS1 127 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DERL1Q9BUN8 251 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PARLQ9H300 379 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOLR2P14207 255 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGAP20933 346 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 B2MP61769 119 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf94C9JXX5 98 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1QTNF9P0C862 333 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPPCP23582 126 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STPG3Q8N7X2 389 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPVFQ9HCQ7 196 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CACNA1BQ00975 2339 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 B9A039 149 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOXH1O75593 365 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APOA2P02652 100 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRNDQ9UKY0 176 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REG1AP05451 166 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRCDQ00LT1 54 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLRB1Q12918 225 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEPPQ6URK8 271 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P2RX4Q99571 388 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFA2O43678 99 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A17O43808 307 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COX7A1P24310 79 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NABP2Q9BQ15 211 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DLL1O00548 723 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNF1AP20823 631 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OPRK1P41145 380 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POU2AF1Q16633 256 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C4orf17Q53FE4 359 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNTFRP26992 372 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DLX6P56179 175 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LGALS4P56470 323 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR9G1Q8NH87 305 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A087WWC5 75 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRGC2P03986 189 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EFNB3Q15768 340 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACY3Q96HD9 319 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VPS13CQ709C8 3753 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFB4O95168 129 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MANBALQ9NQG1 85 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAT8Q9UHE5 227 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C5orf52A6NGY3 159 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MPDU1O75352 247 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNB1P62873 340 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms