RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFB8O95169 186 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AARDQ4LEZ3 155 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP23AO75900 390 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AMTP48728 403 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS33Q8NF86 280 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PS18 150 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXH1O75593 365 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AGFG2O95081 481 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR12P47775 334 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPRSS3P57727 454 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 STARD4Q96DR4 205 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf159Q96HA4 380 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNS1Q96KK3 526 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 UHRF2Q96PU4 802 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF253O75346 499 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 HYPMO75409 117 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLC2P0DOY2 106 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLC3P0DOY3 106 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ARG2P78540 354 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4A16Q8NH70 328 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RCHY1Q96PM5 261 aa15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf65H3BRN8 121 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 EFNB3Q15768 340 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR73Q6P4I2 378 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR7Q8TB68 274 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SPINT2O43291 252 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SPINK4O60575 86 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-ND6P03923 174 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PMCHP20382 165 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF83P51522 516 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZN92 141 aa15.11■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GFRA3O60609 400 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-CO2P00403 227 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5G3P0C626 314 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOBP62745 196 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CX3CL1P78423 397 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CD177Q8N6Q3 437 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TXN2Q99757 166 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GNG12Q9UBI6 72 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FABP6P51161 128 aa15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP13Q12802 2813 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP250Q9BV73 2442 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R1X1 148 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 AREGP15514 252 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf202A1L168 122 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR33A8MZF0 331 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10J4P0C629 311 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 C3orf79P0CE67 100 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GNG4P50150 75 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL11P51671 97 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL19P84098 196 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPWQ5EE01 88 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 STPG3Q8N7X2 389 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52E5Q8NH55 327 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.09■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 CGAP01215 116 aa15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 ADH4P08319 380 aa15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 PRRX1P54821 245 aa15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 NIT1Q86X76 327 aa15.08■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL25O15444 150 aa15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 REG1AP05451 166 aa15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 CD46P15529 392 aa15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF134P52741 427 aa15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 RELBQ01201 579 aa15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
RALGPS1-208ENST00000424082 HELTA6NFD8 242 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms