RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PEMTQ9UBM1 199 aa11.7□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TMEM213A2RRL7 107 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 C15orf61A6NNL5 157 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 A8MZ25 164 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 H0Y980 276 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 LGALS9O00182 355 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TPPPO94811 219 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SERPINE2P07093 398 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR13C7P0DN81 318 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 DEFA4P12838 97 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PI3P19957 117 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 RND3P61587 244 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 FAM209BQ5JX69 171 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 GPHB5Q86YW7 130 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 Q8N402 240 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.69□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZNF785A8K8V0 405 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 A8MWP6 167 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 F8W735 103 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 FOLR2P14207 255 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 GPR183P32249 361 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 LCN12Q6JVE5 192 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 RGS5O15539 181 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CLEC3BP05452 202 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 P0C879 139 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PPP5CP53041 499 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CXorf58Q96LI9 332 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 RCHY1Q96PM5 261 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TP53RKQ96S44 253 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 HINT2Q9BX68 163 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PRNDQ9UKY0 176 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 GABARAPH6UMI1 98 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 K7EIM0 57 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 IGKV1-5P01602 117 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CD7P09564 240 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PGAM2P15259 253 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TBPP20226 339 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TMBIM6P55061 237 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 PIGPP57054 158 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR5B3Q8NH48 314 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 MLXQ9UH92 298 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 H3BMQ9 156 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SNAPC5O75971 98 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 IFNA6P05013 189 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 CBLN1P23435 193 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TAS2R19P59542 299 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 TSC22D3Q99576 134 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SPC24-201ENST00000423327 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPC24-201ENST00000423327 A0A0G2JRQ6 117 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms