RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 DDB2Q92466 427 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF497Q6ZNH5 498 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 YPEL1O60688 119 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2BAQ96A08 127 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 YPEL2Q96QA6 119 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 RAXQ9Y2V3 346 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 THADAQ6YHU6 1953 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 NABP1Q96AH0 204 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-201ENST00000418331 SBF1O95248 1867 aa17.96■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0A6YYD4 124 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NDN8 102 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1644Q3SXP7 199 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 VWA8A3KMH1 1905 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TRGV3P03979 118 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NBEAP1P0C6P0 100 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SRIP30626 198 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 VENTXO95231 258 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NMUP48645 174 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 C18orf12Q96KH6 178 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CBY1Q9Y3M2 126 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NEU1Q99519 415 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 S4R3C0 116 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 GPX1P07203 203 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf83Q53S99 150 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF525Q8N782 197 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf52A6NGY3 159 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 LEPROTL1O95214 131 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CGAP01215 116 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF126Q9BV68 326 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ICAM4Q14773 271 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4C46A6NHA9 309 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TCTAP57738 103 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TFF1P04155 84 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXF2Q12947 444 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL7Q9UJT9 491 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 HAX1O00165 279 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-12P01611 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NAT1P18440 290 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SPACA3Q8IXA5 215 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR61Q9BZJ8 451 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV3-15P01624 115 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-23P01764 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 MORN2Q502X0 79 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF502Q8TBZ5 544 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNG8Q8WXS5 425 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM168AQ92567 244 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP1LC3AQ9H492 121 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ROS1P08922 2347 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 A1L4Q6 167 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SIAH2O43255 324 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TRGC1P0CF51 173 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKN1AP38936 164 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R3E3 92 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 MPZP25189 248 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 C21orf62Q9NYP8 219 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 AREGP15514 252 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 DLX6P56179 175 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SMAGPQ0VAQ4 97 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 Q0VFX4 171 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 RAX2Q96IS3 184 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SRP19P09132 144 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 RRN3P1Q2M238 152 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 BIVMQ86UB2 503 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1N2Q8NGR9 330 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SMUG1Q53HV7 270 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 ARPC1AQ92747 370 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 POLEQ07864 2286 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 E9PLN8 166 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R27Q86WC6 154 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 VKORC1Q9BQB6 163 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 UPK2O00526 184 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF24Q7RTU0 167 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms