RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 PP6455Q8WZ26 134 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 TLCD1Q96CP7 247 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 OPALINQ96PE5 141 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 TBX5Q99593 518 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRK-210ENST00000415055 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-210ENST00000415055 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-210ENST00000415055 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-210ENST00000415055 STX19Q8N4C7 294 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRK-210ENST00000415055 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 NPBQ8NG41 125 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 OR1L1Q8NH94 360 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-210ENST00000415055 C10orf35Q96D05 121 aa3.28□□□□□ -1.88
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