RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 A0A1B0GUS0 222 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 DAPL1A0PJW8 107 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF727A8MUV8 499 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 CRYAAP02489 173 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 COX6B1P14854 86 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 EVI2AP22794 236 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 SEC11AP67812 179 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF85Q03923 595 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF429Q86V71 674 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 COQ2Q96H96 371 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 CADP27708 2225 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 M0R2Z0 102 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 H2BFMP0C1H6 154 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 DANCRP0C864 163 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 LIMS3P0CW19 117 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 LIMS4P0CW20 117 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 CD34P28906 385 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 P2RY1P47900 373 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 RELBQ01201 579 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF92Q03936 586 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 BSPH1Q075Z2 132 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 MIDNQ504T8 468 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ERASQ7Z444 233 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 SPTSSAQ969W0 71 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 AP1S3Q96PC3 154 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 C5orf49A4QMS7 147 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 OR2T8A6NH00 312 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 F2RL2O00254 374 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 PMCHP20382 165 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 LHX4Q969G2 390 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 MBD6Q96DN6 1003 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 C4orf45Q96LM5 186 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-201ENST00000351328 A0A0G2JLM5 398 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 PRR32B1ATL7 298 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 F5H5K5 113 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 SFT2D2O95562 160 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 CD3EP07766 207 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 OR4F4Q96R69 305 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ST20Q9HBF5 79 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 A0A1B0GX51 115 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 M0R135 149 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 CYB5AP00167 134 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 HLA-DRB1P01911 266 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 TACSTD2P09758 323 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 EGR1P18146 543 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ATP1B3P54709 279 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ZNF799Q96GE5 643 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 PECRQ9BY49 303 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 PARLQ9H300 379 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 DHDHQ9UQ10 334 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 ABCA4P78363 2273 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 A0A0G2JK05 382 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 CD300LBA8K4G0 201 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 CT45A10P0DMU9 189 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 MMP9P14780 707 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-201ENST00000351328 Q6ZVH6 145 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms