RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 EFNB1P98172 346 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NABP1Q96AH0 204 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LHFPL5Q8TAF8 219 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MED12Q93074 2177 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.229e-7■■■□□ 17.6
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SH3BP4-201ENST00000344528 RARRES2Q99969 163 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FHITP49789 147 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 MORN2Q502X0 79 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC5O15389 551 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZP1P60852 638 aa13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 POLEQ07864 2286 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 ICAM4Q14773 271 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF24Q7RTU0 167 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF14Q92956 283 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf83Q53S99 150 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZS92 163 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 ANK1P16157 1881 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV1-13P0DP09 117 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR183P32249 361 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IFITM10A6NMD0 228 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 VENTXO95231 258 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRGC2P03986 189 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AMY1AP04745 511 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMB2P49721 201 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PI4KAP42356 2102 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WV48 116 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV3-15P01624 115 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP4-201ENST00000344528 NUP37Q8NFH4 326 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SGK494Q96LW2 274 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX15Q96SF7 602 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R3E3 92 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF16Q9NXF7 216 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT10AQ9GZT5 417 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087X0M5 115 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GX30 115 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2L6O14933 153 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP4-201ENST00000344528 LYNX1P0DP58 116 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT1P18440 290 aa13.64□□□□□ -0.23
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