RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 HCP5Q6MZN7 132 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 CGB1A6NKQ9 187 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 IGHV2-5P01817 119 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 LGALS7P47929 136 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 C1orf159Q96HA4 380 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 PLXNB1O43157 2135 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-39P01824 125 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF787Q6DD87 383 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRD5 423 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRF3 423 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRM7 423 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 PRTN3P24158 256 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 LCN2P80188 198 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 MGST2Q99735 147 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPI3 338 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR13C7P0DN81 318 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 NPBWR1P48145 328 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ICAM4Q14773 271 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF843Q8N446 348 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SUN5Q8TC36 379 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MBP02144 154 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CRYGBP07316 175 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 HTR1DP28221 377 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PSG5Q15238 335 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 BSXQ3C1V8 233 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 C2orf83Q53S99 150 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TEX45Q8NA69 505 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A22Q9H936 323 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GNG13Q9P2W3 67 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 KPTNQ9Y664 436 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FAM74A7A6NL05 159 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MPDU1O75352 247 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FBP1P09467 338 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PAX6P26367 422 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 LMO4P61968 165 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MLANAQ16655 118 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 DPM3Q9P2X0 92 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ODF3BA8MYP8 253 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SNAPINO95295 136 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 DEFA4P12838 97 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PAX2Q02962 417 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 WT1-ASQ06250 92 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PN81 502 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 TIMM23O14925 209 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 YIF1AO95070 293 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CHRNA7P36544 502 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 OPRK1P41145 380 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 PRSS8Q16651 343 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MIC13Q5XKP0 118 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CCL19Q99731 98 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 FLNCQ14315 2725 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 MED13LQ71F56 2210 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZFP92A6NM28 416 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 GOSR1O95249 250 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-201ENST00000331789 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms