RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CORO2AQ92828 525 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB1CQ92928 201 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A096LNT2 108 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNA17P01571 189 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 NQO2P16083 231 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB4AP20338 218 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ERVK-16P61578 105 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 GNB2P62879 340 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 LCN15Q6UWW0 184 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4A16Q8NH70 328 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 DDB2Q92466 427 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB5AP20339 215 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2B8PP59922 312 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PKIAP61925 76 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS16P62249 146 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RHEBQ15382 184 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TCF23Q7RTU1 214 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF383Q8NA42 475 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SMR3AQ99954 134 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 GNG13Q9P2W3 67 aa12.92□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CR1P17927 2039 aa12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SSX7Q7RTT5 188 aa12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf87Q8N0U7 546 aa12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.91□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 HIVEP1P15822 2718 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIAL4DF5H284 164 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TCAPO15273 167 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 DDTP30046 118 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.9□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf62A8K5M9 175 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BQ15 152 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 FGF7P21781 194 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 THBS3P49746 956 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 CEBPGP53567 150 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RELBQ01201 579 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 HNF4GQ14541 408 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 VWC2Q2TAL6 325 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 LYG1Q8N1E2 194 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52E5Q8NH55 327 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4S2Q8NH73 311 aa12.9□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ACANP16112 2415 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 hADV38S2A0JD32 116 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TMPRSS2O15393 492 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 MMP23AO75900 390 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF429Q86V71 674 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM140Q9NV12 185 aa12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RD3LP0DJH9 198 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RPP30P78346 268 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ACSM6Q6P461 480 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP92A6NM28 416 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV1D-33P01593 117 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV1-33P01594 117 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 MBP02144 154 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 BCL2P10415 239 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 S100A2P29034 98 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 GNG10P50151 68 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF709Q8N972 641 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RHOVQ96L33 236 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ZANQ9Y493 2812 aa12.88□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ARG1P05089 322 aa12.87□□□□□ -0.35
TSNARE1-201ENST00000307180 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms