RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.08□□□□□ -0.48
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PTPRN-201ENST00000295718 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT3O95989 172 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PTPRN-201ENST00000295718 CCL8P80075 99 aa12.02□□□□□ -0.49
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