RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276431.8

TNFRSF10B-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 10b, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF10B, Length 4,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OOEPA6NGQ2 149 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TEPPQ6URK8 271 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WDR86Q86TI4 376 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.58□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CSN3P07498 182 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZNF137PP52743 207 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR1C1Q15619 314 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 EFNB3Q15768 340 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR5B3Q8NH48 314 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 C5orf30Q96GV9 206 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LNP1A1A4G5 178 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TMPRSS2O15393 492 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 STAG3L2P0CL84 134 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 STAG3L3P0CL85 134 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IGLC2P0DOY2 106 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IGLC3P0DOY3 106 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CD24P25063 80 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GAGE1Q13065 139 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LINC00596Q86U02 117 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 APOA2P02652 100 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NPY1RP25929 384 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LGALS4P56470 323 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FOXF2Q12947 444 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SSPNQ14714 243 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.57□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KCNS1Q96KK3 526 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR8B2Q96RD0 313 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TCF19Q9Y242 345 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 Q0VFX4 171 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MLANAQ16655 118 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WDR73Q6P4I2 378 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 Q8NFD4 153 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CT55Q8WUE5 264 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TMEM140Q9NV12 185 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 Q8IYB0 196 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZPBPQ9BS86 351 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PKIBQ9C010 78 aa9.56□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MED13Q9UHV7 2174 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CA2P00918 260 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LYG1Q8N1E2 194 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IL19Q9UHD0 177 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 H3BTX0 84 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TDGF1P13385 188 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TSPOP30536 169 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TNXAQ16473 311 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR4A47Q6IF82 309 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BLNKQ8WV28 456 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OPRK1P41145 380 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 OR2M7Q8NG81 312 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LOXL4Q96JB6 756 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TRIB1Q96RU8 372 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 A0A1W2PN81 502 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NDUFB8O95169 186 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NUDT3O95989 172 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FBLN7Q53RD9 439 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LRRC29Q8WV35 223 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TPPP3Q9BW30 176 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CD46P15529 392 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MPV17P39210 176 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TSKUQ8WUA8 353 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NABP2Q9BQ15 211 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PLCE1Q9P212 2302 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 C10orf142B7Z368 130 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BMPR1BO00238 502 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.54□□□□□ -0.88
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DEFB123Q8N688 67 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms